conohaからubuntu 24.04で同一セグメントで検証したが再現しないのでconoha側の機器の問題ではないと思われるとの回答が来ました。
仕方ないのでごそごそ実験してみた所、IPv6アドレスを複数設定せずに1個だけ設定すれば、17個のIPv6アドレスはどれも疎通することが判りました。一度疎通したIPv6アドレスはサーバをrebootしても疎通状態が継続するので、利用する4個のIPv6アドレスを1個ずつ手動で疎通させた後にサーバをrebootした所、正常に動作するようになりました。ただし、この状態が永続するのか、何らかのタイミングで再び疎通しなくなるのかは不明なので、しばらく運用して様子を見るしかない状態です。